Major Bioinformatics

2021/22, second cycle, full-time degree programme

Basic information

Faculty name:	Faculty of Biochemistry, Biophysics and Biotechnology
Major name:	Bioinformatics
Level:	second cycle
Profile:	General academic
Form:	full-time degree programme
Language of study:	polish

Leading discipline: Biological sciences

Programme

ISCED classification:	0511
Number of semesters:	4
Professional title awarded to graduates:	magister

Description of the program implementation

Program studiów Bioinformatyka (drugiego stopnia) obejmuje (1) przedmioty obowiązkowe (łącznie 42 ECTS); (2) przedmioty do wyboru (co najmniej 20 ECTS do zrealizowania w sem. 1 i 2), (3) pracownię specjalistyczną i dwie magisterskie (łącznie 48 ECTS), (4) praktikum przygotowania pracy magisterskiej w formie pisemnej rozprawy (5 ECTS), (5) lektorat języka angielskiego (studenci wybierają poziom - łącznie 5 ECTS). Obszar kształcenia obowiązkowego został zrealizowany w taki sposób, aby odpowiednie przedmioty miały możliwie niewiele prerekwizytów, dzięki czemu studia Bioinformatyka (drugiego stopnia) mogą być oferowane absolwentom możliwie wielu studiów pierwszego stopnia, którzy po rozpoczęciu studiów ciągle mają możliwość nadrobienia braków w wiedzy i umiejętnościach realizując przedmioty wymagane do zrealizowania specjalistycznych przedmiotów fakultatywnych. W obszarze kształcenia fakultatywnego, przedmioty oferowane studentom zostały podzielone na cztery kategorie: przedmioty kierunkowe (min. 12 ECTS), przedmioty interdyscyplinarne (zazwyczaj ok. 8 ECTS), przedmioty uzupełniające (max. 3 ECTS) oraz przedmioty humanistyczne i społeczne (co najmniej 2 ECTS). Warto zauważyć, że program studiów daje możliwość wyboru przedmiotów specjalistycznych spoza tej listy. Obszar kształcenia fakultatywnego uzupełniają pracownia specjalistyczna oraz dwie pracownie magisterskie, gdzie studenci pod merytoryczną opieką i nadzorem technicznym doświadczonych dydaktyków i badaczy mogą realizować swoje pasje badawcze związane z bioinformatyką. W planie studiów zawarty jest obowiązkowy przedmiot z zakresu nauk humanistycznych i/lub społecznych (Filozofia przyrody i nauki, 3 ECTS) oraz wymóg wyboru innego przedmiotu z tego zakresu za co najmniej 2 ECTS.

Graduation

Warunkiem ukończenia studiów jest złożenie pracy dyplomowej oraz zdanie egzaminu dyplomowego. Praca dyplomowa jest przygotowywana przez studenta pod kierunkiem promotora, będącego pracownikiem naukowo-dydaktycznym lub naukowym WBBiB i zatrudnionym na stanowisku adiunkta lub profesora. Praca magisterska musi być przygotowana w formie pisemnej zgodnie z wymogami obowiązującymi na WBBiB i dokumentować uzyskane przez studenta oryginalne wyniki przeprowadzonych w ramach realizowanych pracowni magisterskich badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Integralną częścią pracy jest zatwierdzony przez Radę Programową studiów Bioinformatyka (drugiego stopnia) najpóźniej do końca 3 semestru studiów, szczegółowy opis bioinformatycznych aspektów badań, których opis i wyniki zawiera praca. Egzamin dyplomowy zdawany jest przez studenta przed powołaną w tym celu komisją. Egzamin dyplomowy poprzedza krótka prezentacja najważniejszych tez pracy dyplomowej.

List of courses - Winter semester, 2021/22 See additional information
Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification	Mandatory
Course details Classes: 40 h Lecture: 20 h ECTS points: 5.00 Form of verification: exam Mandatory: obligatory	60	5	exam	obligatory
Course details Classes: 15 h Discussion class: 15 h Lecture: 30 h ECTS points: 5.00 Form of verification: exam Mandatory: obligatory	60	5	exam	obligatory
Course details Classes: 15 h Discussion class: 15 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	2	assessment	obligatory
Course details Classes: 15 h Discussion class: 15 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	2	assessment	obligatory
Course details Classes: 15 h Lecture: 15 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	2	assessment	obligatory
Course details Classes: 15 h Lecture: 15 h ECTS points: 3.00 Form of verification: exam Mandatory: obligatory	30	3	exam	obligatory
Bezpieczeństwo i higiena kształcenia Course details distance learning: 5 h ECTS points: 0.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	5	-	assessment	obligatory
Course details distance learning: 5 h ECTS points: 0.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	5	-	assessment	obligatory
Course details ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory				obligatory
Język angielski - poziom B2+ Course details Foreign language class: 30 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	30	2	assessment	elective
Język angielski - poziom C1 Course details Foreign language class: 30 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	30	2	assessment	elective
Course details ECTS points: 3.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory				obligatory
Course details Classes: 30 h Lecture: 30 h ECTS points: 6.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	60	6	assessment	elective
Course details Classes: 30 h Lecture: 30 h ECTS points: 6.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	60	6	assessment	elective
Course details Discussion class: 12 h Lecture: 18 h ECTS points: 3.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	30	3	assessment	elective
Course details ECTS points: 3.00 Form of verification: exam Mandatory: obligatory				obligatory
Course details Discussion class: 45 h Lecture: 30 h ECTS points: 7.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	75	7	assessment	elective
Course details ECTS points: 3.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective				elective
Course details Classes: 30 h Discussion class: 15 h Lecture: 15 h ECTS points: 5.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	60	5	assessment	elective
Course details Classes: 15 h Lecture: 30 h ECTS points: 4.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	45	4	assessment	elective
Course details Classes: 30 h Discussion class: 15 h ECTS points: 3.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	45	3	assessment	elective

See additional information

Program studiów Bioinformatyka (drugiego stopnia) obejmuje (1) przedmioty obowiązkowe (łącznie 42 ECTS); (2) przedmioty fakultatywne podzielone na grupy przedmiotów kierunkowych, interdyscyplinarnych, uzupełniających oraz z nauk humanistycznych i społecznych (łącznie 20 ECTS), (3) pracownie specjalizacyjną i dwie magisterskie (łącznie 48 ECTS), (4) praktikum przygotowania pracy magisterskiej w formie pisemnej rozprawy (5 ECTS), (5) lektorat języka angielskiego (studenci wybierają poziom (B2+ lub C1) - łącznie 5 ECTS.

Studenci kierunku Bioinformatyka (drugiego stopnia) mają możliwość wyboru kursów fakultatywnych w semestrach 1, 2 i 3. Kursy fakultatywne zostały podzielone na grupy K1, K2 i K3 (kursy kierunkowe), grupy S1, S2 i S3 (kursy interdyscyplinarne), grupy U1 i U2 (kursy uzupełniające) oraz grupę H2 (kursy z nauk humanistycznych i społecznych). Student w całym cyklu kształcenia musi zrealizować co najmniej 20 ECTS w ramach kursów kierunkowych lub interdyscyplinarnych, przy czym co najmniej 12 ECTS z tej puli musi zostać zrealizowanych w ramach kursów kierunkowych a reszta z kursów interdyscyplinarnych (z grup S1, S2 i S3) albo uzupełniających (z grup U1 i U2, nie więcej niż 3 ECTS). Student na podstawie pisemnego wniosku pozytywnie zaopiniowanego przez Kierownika studiów i po uzyskaniu zgody Prodziekana ds. dydaktyki może zrealizować inne kursy fakultatywne (spoza grup K1-K3, S1-S3 i U1-U2), jednak łączna liczba ECTS zaliczonych na potrzeby zaliczenia fakultatywnych kursów interdyscyplinarnych nie może przekroczyć 3 ECTS. Na potrzebę zaliczenia kursów z grupy H2, student może wybrać dowolny kurs z oferty dydaktycznej Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie, któremu jest przypisany jeden z następujących kodów ISCED: 021x, 022x, 031x oraz 032x (gdzie x to dowolna cyfra).

Warunkiem ukończenia studiów jest złożenie pracy dyplomowej oraz zdanie egzaminu dyplomowego. Praca dyplomowa jest przygotowywana przez studenta pod kierunkiem promotora, będącego pracownikiem naukowo-dydaktycznym lub naukowym WBBiB i zatrudnionym na stanowisku adiunkta lub profesora. Studenci wybierają promotora swojej pracy magisterskiej do końca pierwszego semestru studiów i mogą zmienić swój wybór tylko jeden raz w całym toku studiów nie później jednak niż na początku drugiego roku studiów. Praca magisterska musi być przygotowana w formie pisemnej zgodnie z wymogami obowiązującymi na WBBiB i dokumentować uzyskane przez studenta oryginalne wyniki przeprowadzonych w ramach realizowanych pracowni magisterskich badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Integralną częścią pisemnej rozprawy jest zatwierdzony przez Radę Programową studiów Bioinformatyka (drugiego stopnia) najpóźniej do końca 3 semestru studiów, szczegółowy opis bioinformatycznych aspektów badań, których opis i wyniki zawiera rozprawa. Egzamin dyplomowy zdawany jest przez studenta przed powołaną w tym celu komisją. Egzamin dyplomowy poprzedza krótka prezentacja najważniejszych tez pracy dyplomowej.

List of courses - Summer semester, 2021/22 See additional information
Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification	Mandatory
Course details Classes: 18 h Discussion class: 12 h Lecture: 15 h ECTS points: 4.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	45	4	assessment	obligatory
Course details Classes: 15 h Lecture: 15 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	2	assessment	obligatory
Course details Discussion class: 30 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	2	assessment	obligatory
Course details Seminar: 30 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	2	assessment	obligatory
Course details Workshop/Laboratory class: 120 h ECTS points: 8.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	120	8	assessment	obligatory
Course details Classes: 10 h Lecture: 20 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	2	assessment	obligatory
Course details ECTS points: 3.00 Form of verification: exam Mandatory: obligatory				obligatory
Język angielski - poziom B2+ Course details Foreign language class: 30 h ECTS points: 3.00 Form of verification: exam Mandatory: elective	30	3	exam	elective
Język angielski - poziom C1 Course details Foreign language class: 30 h ECTS points: 3.00 Form of verification: exam Mandatory: elective	30	3	exam	elective
Course details ECTS points: 9.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory				obligatory
Course details Classes: 30 h Lecture: 30 h ECTS points: 5.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	60	5	assessment	elective
Course details Classes: 30 h Discussion class: 15 h ECTS points: 4.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	45	4	assessment	elective
Course details Classes: 15 h Lecture: 15 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	30	2	assessment	elective
Course details ECTS points: 5.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory				obligatory
Course details Classes: 30 h Lecture: 30 h ECTS points: 5.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	60	5	assessment	elective
Course details Classes: 30 h Lecture: 15 h ECTS points: 4.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	45	4	assessment	elective
Course details Lecture: 30 h ECTS points: 3.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	30	3	assessment	elective
Course details ECTS points: 3.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory				obligatory
Course details Classes: 30 h Lecture: 60 h ECTS points: 7.00 Form of verification: exam Mandatory: elective	90	7	exam	elective
Course details ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory				obligatory
Course details Seminar: 20 h Lecture: 10 h ECTS points: 3.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	30	3	assessment	elective

See additional information

Warunkiem ukończenia studiów jest złożenie pracy dyplomowej oraz zdanie egzaminu dyplomowego. Praca dyplomowa jest przygotowywana przez studenta pod kierunkiem promotora, będącego pracownikiem naukowo-dydaktycznym lub naukowym WBBiB i zatrudnionym na stanowisku adiunkta lub profesora. Studenci wybierają promotora swojej pracy magisterskiej do końca pierwszego semestru studiów i mogą zmienić swój wybór tylko jeden raz w całym toku studiów nie później jednak niż na początku drugiego roku studiów. Praca magisterska musi być przygotowana w formie pisemnej zgodnie z wymogami obowiązującymi na WBBiB i dokumentować uzyskane przez studenta oryginalne wyniki przeprowadzonych w ramach realizowanych pracowni magisterskich badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Integralną częścią pisemnej rozprawy jest zatwierdzony przez Radę Programową studiów Bioinformatyka (drugiego stopnia) najpóźniej do końca 3 semestru studiów, szczegółowy opis bioinformatycznych aspektów badań, których opis i wyniki zawiera rozprawa. Egzamin dyplomowy zdawany jest przez studenta przed powołaną w tym celu komisją. Egzamin dyplomowy poprzedza krótka prezentacja najważniejszych tez pracy dyplomowej.

List of courses - Winter semester, 2022/23 See additional information
Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification	Mandatory
Course details Classes: 30 h Lecture: 30 h ECTS points: 6.00 Form of verification: exam Mandatory: obligatory	60	6	exam	obligatory
Course details Workshop/Laboratory class: 300 h ECTS points: 20.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	300	20	assessment	obligatory
Course details ECTS points: 4.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory				obligatory
Course details Discussion class: 15 h Lecture: 30 h ECTS points: 4.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	45	4	assessment	elective
Course details ECTS points: 6.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory				obligatory
Course details Classes: 30 h Lecture: 30 h ECTS points: 6.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	60	6	assessment	elective
Course details Classes: 30 h Lecture: 30 h ECTS points: 6.00 Form of verification: assessment Mandatory: elective	60	6	assessment	elective

See additional information

Warunkiem ukończenia studiów jest złożenie pracy dyplomowej oraz zdanie egzaminu dyplomowego. Praca dyplomowa jest przygotowywana przez studenta pod kierunkiem promotora, będącego pracownikiem naukowo-dydaktycznym lub naukowym WBBiB i zatrudnionym na stanowisku adiunkta lub profesora. Studenci wybierają promotora swojej pracy magisterskiej do końca pierwszego semestru studiów i mogą zmienić swój wybór tylko jeden raz w całym toku studiów nie później jednak niż na początku drugiego roku studiów. Praca magisterska musi być przygotowana w formie pisemnej zgodnie z wymogami obowiązującymi na WBBiB i dokumentować uzyskane przez studenta oryginalne wyniki przeprowadzonych w ramach realizowanych pracowni magisterskich badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Integralną częścią pisemnej rozprawy jest zatwierdzony przez Radę Programową studiów Bioinformatyka (drugiego stopnia) najpóźniej do końca 3 semestru studiów, szczegółowy opis bioinformatycznych aspektów badań, których opis i wyniki zawiera rozprawa. Egzamin dyplomowy zdawany jest przez studenta przed powołaną w tym celu komisją. Egzamin dyplomowy poprzedza krótka prezentacja najważniejszych tez pracy dyplomowej.

List of courses - Summer semester, 2022/23 See additional information
Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification	Mandatory
Course details Seminar: 30 h ECTS points: 3.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	3	assessment	obligatory
Course details Workshop/Laboratory class: 300 h ECTS points: 20.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	300	20	assessment	obligatory
Course details consultation with supervisor: 30 h ECTS points: 5.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	5	assessment	obligatory
Course details Seminar: 30 h ECTS points: 2.00 Form of verification: assessment Mandatory: obligatory	30	2	assessment	obligatory

See additional information

Warunkiem ukończenia studiów jest złożenie pracy dyplomowej oraz zdanie egzaminu dyplomowego. Praca dyplomowa jest przygotowywana przez studenta pod kierunkiem promotora, będącego pracownikiem naukowo-dydaktycznym lub naukowym WBBiB i zatrudnionym na stanowisku adiunkta lub profesora. Studenci wybierają promotora swojej pracy magisterskiej do końca pierwszego semestru studiów i mogą zmienić swój wybór tylko jeden raz w całym toku studiów nie później jednak niż na początku drugiego roku studiów. Praca magisterska musi być przygotowana w formie pisemnej zgodnie z wymogami obowiązującymi na WBBiB i dokumentować uzyskane przez studenta oryginalne wyniki przeprowadzonych w ramach realizowanych pracowni magisterskich badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Integralną częścią pisemnej rozprawy jest zatwierdzony przez Radę Programową studiów Bioinformatyka (drugiego stopnia) najpóźniej do końca 3 semestru studiów, szczegółowy opis bioinformatycznych aspektów badań, których opis i wyniki zawiera rozprawa. Egzamin dyplomowy zdawany jest przez studenta przed powołaną w tym celu komisją. Egzamin dyplomowy poprzedza krótka prezentacja najważniejszych tez pracy dyplomowej.