Bioinformatics

Basic information

Faculty name:	Faculty of Biochemistry, Biophysics and Biotechnology
Major name:	Bioinformatics
Level:	first cycle
Profile:	General academic
Form:	full-time degree programme
Language of study:	polish

Leading discipline: Biological sciences

Programme

ISCED classification: 0511

Number of semesters: 6

Professional title awarded to graduates: licencjat

Description of the program implementation

Program studiów Bioinformatyka (pierwszego stopnia) obejmuje: (1) przedmioty obowiązkowe (122 ECTS), (2) fakultatywne przedmioty kierunkowe (36 ECTS), (3) pracownie specjalizacyjną (120h, 8 ECTS) i praktikum pisania pracy dyplomowej (2 ECTS), (4) praktyki zawodowe (3 ECTS) oraz (5) lektorat języka angielskiego (student wybiera poziom lektoratu, łącznie 9 ECTS).

Grupę kursów obowiązkowych tworzą kursy z różnych działów matematyki i informatyki, kursy budujące solidne podstawy wiedzy z nauk przyrodniczych (chemia, fizyka, biologia) oraz kursy niezbędne dla przyszłego bioinformatyka analizującego dane biologiczne generowane w różnych dziedzinach nauk o życiu. Grupę tę uzupełniają zajęcia z WF oraz kursy z dziedziny nauk społecznych ("Wstęp do filozofii" (3 ECTS) oraz "Bioetyka dla bioinformatyków" (2 ECTS). Przedmioty kierunkowe są wybierane przez studentów od 4 semestru nauki.

Uwieńczeniem studiów jest przygotowanie pisemnej pracy licencjackiej dokumentującej wyniki badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Nad właściwym doborem tematyki prac licencjackich czuwa oprócz opiekuna pracy, Rada Programowa kierunku Bioinformatyka (pierwszego stopnia), do której obowiązków należy zatwierdzenie zgłoszonej przez studenta krótkiej listy aspektów bioinformatycznych badań stanowiących przedmiot jego pracy dyplomowej. Ostatnim akcentem w procesie kształceani licencjatów z bioinformatyki jest pisemny egzamin dyplomowy, w którym pytania testowe zostały sformułowane z uwzględnieniem efektów kształcenia przypisanych kursom obligatoryjnie realizowanych przez studenta w toku studiów.

Graduation

Oprócz wymagań opisanych regulaminem studiów UJ, poniżej podano wyjaśnienia wybranych kryteriów rozpatrywanych przy podejmowaniu decyzji o pomyślnym ukończeniu studiów Bioinformatyka (pierwszego stopnia):

(1) złożenie pozytywnie ocenionej pracy dyplomowej,

(2) pozytywny wynik pisemnego egzaminu dyplomowego,

(3) zaliczenie przedmiotów obowiązkowych i fakultatywnych, którym łącznie odpowiada co najmniej 180 ECTS.

Uwieńczeniem studiów jest przygotowanie pisemnej pracy licencjackiej dokumentującej wyniki badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Nad właściwym doborem tematyki prac licencjackich czuwa oprócz opiekuna pracy, Rada Programowa kierunku Bioinformatyka (pierwszego stopnia), do której obowiązków należy zatwierdzenie zgłoszonej przez studenta krótkiej listy aspektów bioinformatycznych badań stanowiących przedmiot jego pracy dyplomowej. Ostatnim akcentem w procesie kształcenia licencjatów z bioinformatyki jest pisemny egzamin dyplomowy, w którym pytania testowe zostały sformułowane z uwzględnieniem efektów kształcenia przypisanych kursom obligatoryjnie realizowanych przez studenta w toku studiów.

Program studiów Bioinformatyka (pierwszego stopnia) obejmuje obowiązkowe praktyki zawodowe w liczbie 90h (3 ECTS) realizowane po trzecim semestrze studiów, ale studenci mogą zaliczyć je także w innym terminie. Jako praktyki zawodowe mogą być zaliczone również staże realizowane w ramach programów wspierających mobilność edukacyjną (np. ERASMUS+).

Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification
Algebra liniowa	60	6	exam	O
Bioinformatyka 1	60	5	exam	O
Logika i teoria mnogości	60	6	exam	O
Podstawy biologii	45	3	assessment	O
Principles of chemistry	60	6	exam	O
Wstęp do informatyki	60	6	exam	O
Health and Safety in Education	5	-	assessment	O
Szkolenie USOSweb dla studentów WBBiB	5	-	assessment	O
Physical Education	30	-	assessment	O

Uwieńczeniem studiów jest przygotowanie pisemnej pracy licencjackiej dokumentującej wyniki badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Nad właściwym doborem tematyki prac licencjackich czuwa oprócz opiekuna pracy, Rada Programowa kierunku Bioinformatyka (pierwszego stopnia), do której obowiązków należy zatwierdzenie zgłoszonej przez studenta krótkiej listy aspektów bioinformatycznych badań stanowiących przedmiot jego pracy dyplomowej. Ostatnim akcentem w procesie kształcenia licencjatów z bioinformatyki jest pisemny egzamin dyplomowy, w którym pytania testowe zostały sformułowane z uwzględnieniem efektów kształcenia przypisanych kursom obligatoryjnie realizowanych przez studenta w toku studiów.

Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification
Analiza matematyczna 1	75	6	assessment	O
Biochemistry	90	7	exam	O
Biologia ewolucyjna	30	2	assessment	O
Ilościowa biologia komórki	60	4	assessment	O
Programowanie 1	75	6	assessment	O
Programy użytkowe w systemie GNU/Linux	45	3	assessment	O
Physical Education	30	-	assessment	O

Uwieńczeniem studiów jest przygotowanie pisemnej pracy licencjackiej dokumentującej wyniki badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Nad właściwym doborem tematyki prac licencjackich czuwa oprócz opiekuna pracy, Rada Programowa kierunku Bioinformatyka (pierwszego stopnia), do której obowiązków należy zatwierdzenie zgłoszonej przez studenta krótkiej listy aspektów bioinformatycznych badań stanowiących przedmiot jego pracy dyplomowej. Ostatnim akcentem w procesie kształcenia licencjatów z bioinformatyki jest pisemny egzamin dyplomowy, w którym pytania testowe zostały sformułowane z uwzględnieniem efektów kształcenia przypisanych kursom obligatoryjnie realizowanych przez studenta w toku studiów.

Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification
Analiza matematyczna 2	75	6	exam	O
Bazy danych	75	7	exam	O
Programowanie 2	75	6	exam	O
Biologia systemów	60	5	exam	O
Genetyka molekularna	70	6	exam	O
Zajęcia wyrównawcze z fizyki	30	2	assessment	O
Grupa L1 - obowiązkowy lektorat, student wybiera poziom				O
Język angielski - poziom B2	30	2	assessment	F
Język angielski - poziom C1	30	2	assessment	F

Uwieńczeniem studiów jest przygotowanie pisemnej pracy licencjackiej dokumentującej wyniki badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Nad właściwym doborem tematyki prac licencjackich czuwa oprócz opiekuna pracy, Rada Programowa kierunku Bioinformatyka (pierwszego stopnia), do której obowiązków należy zatwierdzenie zgłoszonej przez studenta krótkiej listy aspektów bioinformatycznych badań stanowiących przedmiot jego pracy dyplomowej. Ostatnim akcentem w procesie kształcenia licencjatów z bioinformatyki jest pisemny egzamin dyplomowy, w którym pytania testowe zostały sformułowane z uwzględnieniem efektów kształcenia przypisanych kursom obligatoryjnie realizowanych przez studenta w toku studiów.

Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification
Podstawy fizyki	60	5	exam	O
Rachunek prawdopodobieństwa i statystyka	60	5	exam	O
Wstęp do filozofii	45	3	assessment	O
Grupa L2 - obowiązkowy lektorat, student wybiera poziom				O
Język angielski - poziom B2	30	2	assessment	F
Język angielski - poziom C1	30	2	assessment	F
Grupa K1 - fakultatywne przedmioty kierunkowe				O
Student musi wybrać przedmioty za minimum 11 ECTS i 120 godz.
Analiza danych w badaniach układów biologicznych	60	4	assessment	F
Biomechanika komórki	30	2	assessment	F
Komputerowe modelowanie procesów biologicznych	45	3	assessment	F
Metody programowania	60	6	assessment	F
Neurochemia	60	5	assessment	F
Neurochemia - wykład	30	2	assessment	F
Praktyki zawodowe (3 tyg)	90	3	assessment	O

Uwieńczeniem studiów jest przygotowanie pisemnej pracy licencjackiej dokumentującej wyniki badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Nad właściwym doborem tematyki prac licencjackich czuwa oprócz opiekuna pracy, Rada Programowa kierunku Bioinformatyka (pierwszego stopnia), do której obowiązków należy zatwierdzenie zgłoszonej przez studenta krótkiej listy aspektów bioinformatycznych badań stanowiących przedmiot jego pracy dyplomowej. Ostatnim akcentem w procesie kształcenia licencjatów z bioinformatyki jest pisemny egzamin dyplomowy, w którym pytania testowe zostały sformułowane z uwzględnieniem efektów kształcenia przypisanych kursom obligatoryjnie realizowanych przez studenta w toku studiów.

Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification
Bioetyka dla bioinformatyków	30	2	assessment	O
Chemia obliczeniowa	60	5	exam	O
Genomika funkcjonalna	45	3	assessment	O
Modelowanie molekularne 1	60	5	exam	O
Grupa L3 - obowiązkowy lektorat, student wybiera poziom				O
Język angielski - poziom B2	30	2	assessment	F
Język angielski - poziom C1	30	2	assessment	F
Grupa K2 - fakultatywne przedmioty kierunkowe				O
Student musi wybrać przedmioty za minimum 13 ECTS i 150 godz.
Algorytmy i struktury danych	75	7	assessment	F
Biochemia kwasów nukleinowych	30	2	assessment	F
Biologia nowotworów - aspekty biofizyczne	30	2	assessment	F
Biologia strukturalna błon	60	5	assessment	F
Między fizyką a biologią	30	2	assessment	F
Milestones in Biotechnology	20	2	assessment	F
Podstawy immunologii	45	4	assessment	F
Principles of molecular bioenergetics	30	3	assessment	F

Uwieńczeniem studiów jest przygotowanie pisemnej pracy licencjackiej dokumentującej wyniki badań z zakresu szeroko rozumianej bioinformatyki. Nad właściwym doborem tematyki prac licencjackich czuwa oprócz opiekuna pracy, Rada Programowa kierunku Bioinformatyka (pierwszego stopnia), do której obowiązków należy zatwierdzenie zgłoszonej przez studenta krótkiej listy aspektów bioinformatycznych badań stanowiących przedmiot jego pracy dyplomowej. Ostatnim akcentem w procesie kształcenia licencjatów z bioinformatyki jest pisemny egzamin dyplomowy, w którym pytania testowe zostały sformułowane z uwzględnieniem efektów kształcenia przypisanych kursom obligatoryjnie realizowanych przez studenta w toku studiów.

(1) złożenie pozytywnie ocenionej pracy dyplomowej,
(2) pozytywny wynik pisemnego egzaminu dyplomowego,
(3) zaliczenie przedmiotów obowiązkowych i fakultatywnych, którym łącznie odpowiada co najmniej 180 ECTS.

Subject	Number of hours	ECTS points	Form of verification
Diploma Laboratory Class	120	8	assessment	O
Praktikum pisania pracy licencjackiej	20	2	assessment	O
Diploma Seminar	30	2	assessment	O
Grupa L4 - obowiązkowy lektorat, student wybiera poziom				O
Język angielski - poziom B2	30	3	exam	F
Język angielski - poziom C1	30	3	exam	F
Grupa K3 - fakultatywne przedmioty kierunkowe				O
Student musi wybrać przedmioty za minimum 15 ECTS i 180 godz.
Biochemia roślin	75	6	assessment	F
Biologia molekularna nowotworów człowieka	30	3	assessment	F
Biologia molekularna prokariontów	60	5	assessment	F
Geny i choroby genetyczne	30	2	assessment	F
Neurobiocybernetyka i biofizyka zmysłów	45	4	assessment	F
Obrazowanie wnętrza organizmu	45	3	assessment	F